Classroom of the Elite – Di permukaan, SMA Koudo Ikusei adalah utopia. Para siswa menikmati jumlah kebebasan yang tak tertandingi, dan berperingkat tinggi di Jepang. Namun, kenyataannya kurang ideal. Empat kelas, A sampai D, diberi peringkat sesuai urutan, dan hanya kelas atas yang menerima perlakuan yang menguntungkan.
Kiyotaka Ayanokouji adalah siswa Kelas D, di mana sekolah itu yang terburuk. Di sana ia bertemu dengan Suzune Horikita yang tidak ramah, yang percaya bahwa dia ditempatkan di Kelas D secara tidak sengaja dan ingin memanjat sampai ke Kelas A, dan idola kelas yang tampaknya ramah Kikyou Kushida, yang tujuannya adalah untuk membuat teman sebanyak mungkin.
Meskipun keanggotaan kelas bersifat permanen, peringkat kelas tidak; siswa di kelas bawah dapat naik peringkat jika skor mereka lebih baik daripada yang di peringkat teratas. Selain itu, di Kelas D, tidak ada bar tentang metode apa yang dapat digunakan untuk maju. Di sekolah kejam ini, bisakah mereka menang melawan rintangan dan mencapai puncak?
